日本牙科在明治时代（1868-1912）西化和随后的医疗体制改革之后成为一个独立的医学领域。在明治之前的时代，牙齿问题主要作为口腔医学的一部分进行治疗。1874年，东京开设了第一家以现代欧洲牙科医学为基础的牙医执照诊所。1948年，《医疗法案》和《牙医法案》颁布后，许多大学整合了牙科部门。1960年代和1970年代，牙医和牙科诊所的数量进一步增加。在过去十年中，日本的牙医和治疗中心数量保持不变，约有68000家牙科诊所，约为每100000居民54家诊所。现代社会中的牙科诊所在现代日本社会中，牙科主要通过牙科诊所的门诊服务提供。例如，只有症状严重需要全身麻醉手术的患者，才倾向于在牙科或牙科手术部门的综合医院接受治疗。与医院最常见的医疗公司不同，牙科诊所通常为私人所有。牙科专业主要分为牙医、牙医和牙医技师。牙科保健师协助患者的治疗和手术，而牙科技术人员则制造与牙齿相关的部件，如假牙和假牙。由于该国许多地区人口停滞不前或下降，近年来牙科诊所供应过剩已成为一个问题。因此，越来越多的牙科诊所提供更加专业化和以利润为导向的服务，如牙科植入物或牙齿美白，两者都不在保险范围之内。2021 8月进行的一项调查显示，在冠状病毒病（新冠肺炎）传播后，日本的一些患者减少了去牙科诊所的频率。这一发展的长期影响尚不清楚。老龄人口的牙齿健康直到最近，日本牙科的重点还是治疗已经受损的硬组织，如根管治疗或修复。由于人口迅速老龄化，以及随后包括牙科治疗在内的国家医疗支出的增加，重点逐渐转向预防性治疗，例如牙周病。为卧床不起的患者在家或护理机构进行牙科治疗也变得越来越普遍。卫生部和日本牙科协会开展了诸如“8020-20颗80岁牙齿”等推广项目。这旨在提高对正确维护牙齿和牙龈重要性的认识。截至2018年，70岁以上、牙齿保持20颗以上的人口比例从2004年的29%增加到45%左右。