有机食品市场是日本食品市场中的新兴市场。尽管2000年实施了关于植物性农产品的第一项法规，但有机蔬菜在农业部门中的份额仍然很低。经过逐步修订，日本有机农业标准（JAS）被确立为在日本销售的有机食品的行业标准。日本政府一直在努力提高人们对有机食品行业的认识，通过实施严格的标签规定来防止误导性广告。为了进一步刺激国内需求，MAFF为积极处理有机食品的企业推出了“日本有机支持者”平台。但是，尽管开展了促销活动，提高了人们的认识水平，但只有少数消费者了解有机JAS标志的附加价值。虽然保健食品行业一直受益于对健康生活方式和健康饮食习惯日益增长的需求，但有机食品行业面临着与传统食品行业相区别的挑战。另一方面，有机非食品正在吸引消费者的兴趣。除食品外的消费品不受有机JAS法规的约束，导致有机化妆品和有机棉花等新细分市场的兴起。虽然有机棉没有资格获得有机认证，但它仍然可以作为“有机”产品销售，并作为一种可持续材料在时尚行业中广受欢迎。