自20世纪70年代末以来，世界卫生组织（WHO）制定的基本医疗战略也成为印尼政府卫生政策的一部分。尽管在某些领域取得了进展，但该国在广泛人群的医疗保健方面仍存在严重不足。一个关键问题是穷人人数众多：饥饿和营养不良同得不到清洁饮用水、大城市环境影响大以及不卫生的住房条件一样，也是许多人日常生活的一部分。卫生基础设施除了总体卫生状况外，迫切需要对卫生基础设施进行改革。首先，必须新建医院。根据印尼卫生部的数据，2019年，该国医院数量达到2344家。这表明每10万居民只有一家医院。医院床位也不成比例地少，约为31.7万张。至于医生人数，2019年，印尼记录在案的全科医生接近14.4万人。印尼目前的医疗保健主要基于所谓的Puskesmasas（Pusat kesehatan masyarakat：公共医疗中心）。这些是经过培训的护士提供最必要服务的卫生设施，如接种疫苗、为孕妇提供维生素补充剂或包扎伤口。医生只在特定时间在场。2019年，该国大约有一万家正在运作的社区卫生中心。尤其是在没有医院的贫困和偏远地区或省份。印尼卫生系统为了减少被压抑的巨大需求，印尼政府于2015年初推出了一般健康保险。2019年，国家健康保险印尼健康卡（JKN-KIS）覆盖了约2.24亿人。此外，新的健康保险制度只提供基本保险，特别是因为缴费率每月只有几欧元。因此，任何患有疟疾、登革热甚至结核病的人都无法指望得到最先进的治疗，尽管近年来登革热病例的增加证明了建立适当的卫生系统的必要性。